孕早期是胎儿大脑发育的快速时期，这时候缺碘会影响到神经细胞的增殖分化、脑蛋白合成障碍，而脑蛋白质含量减少会使细胞体积缩小、脑重量减轻，直接影响到胎宝宝智力发育。
另外，孕早期缺碘，胎儿的甲状腺激素也会受影响，这会直接干扰中枢神经发育，对大脑产生伤害，有可能影响宝宝智力发育。
孕中后期缺碘孕妈妈娩出的孩子通常无论是头围、身高还是体重都难以达标，这类宝宝普遍发育迟钝，个头矮小，反应慢，性器官出现异常，听说能力差。一旦准妈妈身体中的碘含量少于25ug/d时，宝宝就有患上克汀病的风险。
孕晚期中度碘缺乏会造成孕妈咪在妊娠晚期出现甲状腺机能减退，而在那些严重缺碘的孕妈咪中，甲状腺机能减退的发生率可达1/3。
