长期缺钙会导致控制神经系统的能力下降，这样夜间神经也始终处于亢奋的状态，就容易失眠，难以入睡。即使睡着了也很容易多梦，容易做梦的人睡眠的质量不好。
钙缺乏很容易导致骨骼疾病。儿童如果缺钙会导致佝偻病，鸡胸，缺钙的孩子会出现生长痛;如果成人缺钙会导致腰酸背痛、骨质增生;老年人缺钙就会导致骨质疏松，容易骨折。很多老年人因为缺钙，50以上就会出现驼背，还有一些人因为缺钙，导致股骨头坏死。
人的疼痛的感觉是由神经传导和控制，如果缺钙，导致神经敏感，痛感更强，女性就会感觉到非常明显的痛经。所以，痛经的女性日常要多注意补钙。
钙是构成牙釉质和牙骨质的主要成分，龋齿会造成牙齿硬组织脱钙，软组织崩解，形成龋洞而感染牙髓，人体缺钙就会加快这一过程。
糖尿病
人体严重缺钙会导致胰岛素分泌绝对和相对不足，从而加重糖尿病病情。持续性高血糖会造成排尿增多，使大量钙质随尿排出，引起血钙降低，进而加速骨钙析出，出现骨质疏松。所以钙缺乏是糖尿病并发症之一。
低血钙易刺激下丘脑调节摄食活动的神经核，使人总有饥饿感，引发进食过多，导致肥胖症。
钙摄取量与高血压发病呈反比关系。钙缺乏会促进血压的升高，钙调节激素直接控制血清钙的水平，同时间接地起着血压调节作用。缺钙可使机体血压升高，而高钙饮食能起到降压的作用。
钙除了通过降低血压来保护心脏外，还可以帮助降低血中胆固醇，特别是降低危害最大的低密度脂蛋白胆固醇，从而达到保护心脏的作用。
脑血栓与脑栓塞
人体缺钙可加速骨钙析出，而引发脑动脉粥样硬化，造成脑血管堵塞，形成血栓，致使脑组织缺血，缺氧而发生坏死，从而产生局部脑组织功能缺失。粥样硬化溃疡斑脱落后，进入脑动脉或颈动脉，会引起脑部血流阻塞，而发生脑栓塞，加速脑组织坏死。
自骨骼中游离出来的钙离子沉积在血管壁上，促进动脉粥样硬化的发生。另外，高血压，高脂血症也会引起钙离子进入细胞增多，引起细胞坏死，血小板及巨嗜细胞集中而引起动脉粥样硬化，导致动脉内胆固醇增加，增加钙盐沉积。
当人体缺钙或患骨质疏松时，甲状旁腺素分泌量增加，会杀死脑神经细胞，而导致痴呆症。
胆汁反流会使胃肠道消化功能紊乱，影响机体对钙的有效吸收，引起钙代谢紊乱，细胞内钙离子浓度增加，促进胃酸分泌，胃蛋白酶增加，从而导致消化道溃疡发生。
肝炎
钙能够增强毛细血管致密性，减少肝内水肿，抗过敏和稳定自主神经末梢，提高淋巴细胞活性及机体免疫反应，防止肝细胞坏死，对病毒性肝炎有辅助治疗作用。
肝硬化会造成维生素D活性降低，肠道对钙吸收减少，使患者体内缺钙，引发食欲减退，腹胀。维生素D摄入不足，体内钙消耗又增加，导致缺钙更明显，而引起机体钙，磷代谢紊乱，肝细胞内钙离子浓度增加，血管收缩，肝血流减少，造成肝细胞功能障碍。
钙具有促进血液循环，保持血管弹性和韧性的功能。体内钙量充足，细胞内钙的浓度平衡，既可增加机体免疫系统的抵抗力，避免和减少感染，使感染部位愈合快。
婴幼儿缺钙导致生长发育迟缓，免疫功能低下及胸廓畸形，使呼吸运动受限，继发肺部感染。肺炎及并发呼吸衰竭时，血浆钙浓度降低，肺细胞内钙浓度增高。
哮喘
哮喘的发生与机体缺钙有关。当机体缺钙引起低血钙，使神经兴奋性增强，机体免疫力减低。钙具有抗过敏的作用，补钙对哮喘症状的缓解有帮助。
低血钙是诱发癫痫病的原因之一。钾有调节神经兴奋性的作用，低血钙可引起细胞内的钾大量外流，造成钾泵功能紊乱，使神经兴奋增高，而出现癫痫症。
世界卫生组织(WHO)统计分析表明：人类13五种基础疾病中有10六种与缺钙有关。像骨质疏松与骨质增生，高血压，动脉硬化，和心脏血管病，老年痴呆症，糖尿病，各种结石病，各种过敏性疾病，肝脏疾病，肾病综合症，性功能障碍，经前综合症以及一些癌症等，都跟缺钙有关。
