看生殖器是判断扇贝公母最明显的方法，这一般需要在扇贝繁殖季节过后才知道。公扇贝的生殖腺会呈现乳白色，母扇贝的生殖腺则是橘红色或橘黄色。
公母扇贝的口感味道也不一样。公扇贝吃起来味道会比较鲜甜，甜味会多一些，而母扇贝吃起来会比较鲜香一些，更肥美一些。
无论是公扇贝还是母扇贝，味道都很鲜美，口感其实差不多，只是有一些差异，不过大多数人都吃不来，所以食用不用分公母。若是能吃出来两者之间的差异，只要根据自己的喜好选择就行。
另外，扇贝一般为雌雄异体，也存在雌雄同体的现象，这种是不能分公母的。
