睾丸囊肿是良性的，当它体积较小时，对男性无害，只要定期随访观察睾丸增长速度即可。
囊肿体积增大，甚至压迫到了阴囊，患者就可能出现阴囊下垂、胀痛的现象，对日常工作和生活有一定影响。另外，睾丸疾病久治不愈造成精损肾亏、元气耗损、肢体严寒、腰酸背疼、提早衰老等不适。
若睾丸囊肿的同时还伴有炎症感染，可能诱发精索静脉曲张、静索炎、前列腺炎，内分泌疾病、肾炎等肾脏疾病，严重的甚至会导致死精、无精，影响男性生育能力。
