沙眼衣原体肺炎主要在新生儿及小婴儿发病，由感染的母亲直接传染。
鹦鹉热衣原体肺炎为人通过接触受感染的鸟类或吸入受其分泌物及粪便污染的尘埃而发生肺部感染。
肺炎衣原体通过呼吸道进入人体，在单核细胞内繁殖并释放毒素，经血流播散至肺及全身组织。
衣原体过去曾归属立克次体，现分出成为独立一属。衣原体寄生于宿主细胞内，但不同于病毒，它具有细胞壁，含有DNA和RNA。CT是6个月以下小婴儿肺炎的主要病原之一，多由受感染的母亲通过产道分娩而传染。肺炎衣原体是20世纪80年代中期发现的一种新的衣原体生物种，是严格的人类病原体，不存在动物中间宿主，主要引起人类急性呼吸道感染，尤以肺炎多见，是5岁以上小儿及成人肺炎的病原之一。鹦鹉热衣原体主要寄生于鹦鹉及其禽类和低等哺乳动物体内，人通过与禽类接触或吸入鸟粪或被分泌物污染的羽毛而得病，罕见有人与人之间传播。肺炎衣原体主要通过呼吸道分泌物人与人之间传播，对人类呼吸道肺炎衣原体感染的发病机制及病理改变尚不十分清楚。沙眼衣原体的感染途径：
①胎儿通过母亲产道时直接感染。
②眼部感染衣原体后通过鼻泪管侵入呼吸道。鹦鹉热衣原体侵入呼吸道后经血侵入肝、脾等网状内皮细胞。在单核、吞噬细胞内繁殖后，由血行播散到肺及其他器官，在肺内引起小叶性或间质性肺炎、细支气管炎和支气管上皮细胞脱屑和坏死。病变部位可产生实变和少量出血，肺间质有淋巴细胞浸润，肺门淋巴结可肿大。肝脏可出现局部坏死，脾常肿大，心、肾、神经系统、消化系统等均可受累。
注意事项
1、小儿衣原体肺炎可散发，可流行。潜伏期6～14天。
2、本病病程迁延，长达数周，但多可治愈，鹦鹉热衣原体肺炎重症病死率高，但近年来应用有效抗生素治疗后，病死率明显下降。有作者经血清学调查发现肺炎衣原体感染与冠状动脉粥样硬化性心脏病之间有关联，亦有人发现肺炎衣原体感染可引起哮喘或哮喘性支气管炎，值得研究。
3、本病预后良好，但有报道患儿痊愈随访7～8年后，一部分儿童仍有呼吸道症状如咳、喘和肺功能异常。
4、注意避免过度疲劳，感冒流行时少去公共场所。
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