穿过洞洞鞋的人都知道，鞋子缺乏平衡能力，且鞋后帮很柔软，虽然舒服，但对正处于发育期的孩子起不到支撑作用，会使得脚部左右摇摆，造成脚踝及韧带的扭伤，影响宝宝走路姿势，妨碍脚部发育。
洞洞鞋鞋头宽且软，很容易就被卡住。近年来，穿洞洞鞋被电梯卡住的时间屡见不鲜，甚至有专门的警示牌，专门提醒穿洞洞鞋的人，乘坐扶手电梯时应小心。杭州曾有一个五岁的小男孩，穿洞洞鞋被电梯卡住，伸手去拉鞋时，三根手指被夹断的惨剧。
德国曾有媒体爆料，塑料洞洞鞋中有大量的环芳香烃，这种物质可以通过皮肤进入人体，具有一定的致癌作用，这个调查结果尚有待证实。
