精子是在睾丸内产生的，而患有精索静脉曲张的男性，会对睾丸会产生一些影响，使得睾丸得不到充分营养的供给，这样睾丸内活性物质会不断减少，它所产生的精子质量就会很差，并且数量稀少，从而导致男性出现少精症。
隐睾是指男性睾丸不在阴囊里，这样睾丸就无法发挥自己制造精子的功能，男性精子质量就会下降，出现精子缺少的症状。 除了隐睾外，生殖系统感染也是导致少精症的原因之一。
调查结果已经显示，男性的免疫力和精子质量也挂钩，免疫力比较低下的男性，精子质量水平低，经常会出现少精或死精的状况，比较严重的就会出现少精子症。
男性有染色体异常情况时，尤其是染色体畸变时，也会对精子的密度，活动率等有严重的影响，可能导致少精症的出现。
内分泌异常
男性正常生精功能依赖于下丘脑-垂体-性腺轴功能的正常，其中任何一环节障碍，都会影响生精功能，其他如甲状腺、肾上腺疾病也会影响生殖腺功能而致少精子症。
药物也可以直接或间接影响精子生成，所以若男性服用了磺胺类药、呋喃坦啶、安体舒通、环磷酰胺、氨甲蝶吟、秋水仙碱等药物都对精子有不利于影响，可能导致少精。
男性体内缺乏锌、硒、维生素E等营养元素，也可能导致少精症的发生。
男性长期吸烟酗酒，泡温泉或洗桑拿，穿紧身裤，爱吃烧烤、久坐、熬夜、经常接触放射、化学物质等物质等，都会影响精子数量，导致少精症的发生。
