1、甲状腺不发育或发育不良。
2、由于先天性的缺陷，造成合成甲状腺激素的一些酶的缺乏，使甲状腺激素的合成发生障碍。
3、全身很多组织有甲状腺激素的受体，有这种受体甲状腺激素才能发挥作用。当先天性原因引起组织的甲状腺激素受体的缺陷，尽管甲状腺激素的量不少，也会由于受体的缺陷，使甲状腺激素不能发挥作用，从而出现甲减表现。
1、长期缺碘，使合成甲状腺激素的原料不足，因而甲状腺激素的生成减少。
2、甲状腺手术时，将甲状腺全部切除，或切除的甲状腺组织过多。也可引起甲减。
3、放射性131碘治疗时，131碘用量过大，使甲状腺组织破坏过多，也可出现甲减。
4、各种甲状腺炎造成甲状腺组织的破坏可以引起甲减。
孕妇甲减对胎儿的危害
1、导致宝宝智力下降
甲减女性生下的婴儿罹患某些疾病的危险会增加，其中大多数是智力和发育上的问题：已有多项研究表明，孕妇患临床甲减、亚临床甲减、低T4血症或TPOAb阳性会使流产和妊娠期并发症显著增加，并造成胎儿脑发育障碍，导致后代智商下降6-8分，而患有上述4种疾病的女性占孕妇的10%~15%。
2、增加孩子出生缺陷机会
甲减可能增加孩子的出生缺陷。新的研究发现有甲状腺疾病的妇女更可能生下心脏、肾或脑异常的后代。这项来自美国的研究显示，患有甲状腺疾病的母亲(其中既有甲亢、也有甲减的母亲，以甲减更为多见)生产的婴儿发生出生缺陷(大脑、肾脏、心脏缺陷以及唇裂、腭裂、多指等)的比例约为18%。而在普通人群中，该比例仅为3%左右。
3、流产、早产
甲状腺功能减退的女性在怀孕期间，不能得到早期诊断和及时治疗，可能造成流产、早产、胎盘早剥(非常严重的并发症，会威胁母亲和胎儿的生命)、围产期胎儿死亡等不良生产事件。
孕妇怎么防治甲减
1、甲减患者应在甲功(FT3、FT4、TSH)正常后方可考虑怀孕。需要强调的是，由于妊娠的生理变化，妊娠期的甲状腺功能指标的参考值范围发生变化，需要采用妊娠期特异的参考值范围。普通人群的血清TSH正常范围在0.3~5.0mU/L，而孕期TSH应控制在2.5mU/L以下，FT4保持在非孕妇正常范围的上1/3水平。
2、不能停用甲减治疗药物。有些甲减患者怀孕后由于担心服用甲状腺激素对胎儿产生不利影响而擅自停药，这是非常错误的。甲状腺激素是人体必需的一种生理性激素，对胎儿大脑和骨骼的发育至关重要，一旦缺乏，有可能造成后代“呆小症”。只要替代剂量合适，对人体无任何不良影响。
3、孕期中一定要定期检查。对于甲减合并妊娠的患者，随着孕周的增大，机体对于甲状腺激素的需求量也随着发生变化，所以，必须定期复查甲功，根据TSH和FT4水平，适当调整甲状腺激素(即L-T4)的替代剂量，以确保胎儿的正常发育。
4、如果甲减孕妇来自缺碘地区，患者可以食用碘化盐、碘化食品。服用甲状腺片时应与铁剂，钙剂和维生素至少分开2小时以上服用。
5、分娩最好在综合医院，有病情变化好及时请内分泌专科医生会诊。分娩时脐带血应检测甲功及抗体(FT3、FT4、TSH、TGAb、TPOAb。等)，以及时了解母婴情况，孩子满月后复查上述项目。以及早筛查及时治疗先天性甲减儿。
6、产后要根据甲功检查情况，继续服药及时调整用药剂量。
7、胎儿出生后，也要密切观察婴儿的日常生活，若其出现嗜睡、反应迟钝、不肯进食等情况，应及时就诊。
8、甲减孕妇产后可以正常哺乳
临床实践证明：妊娠合并甲减者，只要在孕期甲状腺激素水平控制满意，甲功基本正常，则母儿预后大多良好，否则母儿的并发症均明显增加。
