香烟中的一氧化碳会降低血液吸收氧气的能力，香烟中的尼古丁能使心跳加快，血压升高，两者结合会造成心脏的承受能力减弱，心肌缺氧引起冠状动脉梗塞，心脏局部缺血(或心胶痛)促使动脉粥样化累积，许多心脏疾病开始发生。烟民心脏发病常见于30和49岁之间，发病率是不吸烟的5倍。
吸烟能引致支气管上皮细胞的纤毛变短和不规则及其和运动发生障碍，降低局部性抵抗力，容易受到感染，同时对肺部的免疫系统产生影响，导致肺部疾病的产生。另外，吸烟亦会引致肺气肿，肺部支气管内积聚之有毒物质，会阻碍人体吸入之空气正常呼出，令肺部细胞膨胀或爆裂，导致患病者呼吸困难。
烟草中的尼古丁可影响钙的吸收，烟碱抑制成骨细胞，刺激破骨细胞的活性，这就让一部分骨钙释放入血以维持正常的血钙水平。如此，就会使骨密度降低，引发骨质疏松。
另外，尼古丁会令血管收缩，降低了流到新生骨骼的血量，导致流产关节盘的血液减少，关节盘出现提早退化，从而造成关节炎。
吸烟会加重肝脏的负担。因为肝脏是身体内以代谢功能为主的一个器官，而经常抽烟会影响肝脏的脂质代谢作用，令血中脂肪增加，使到良性胆固醇减少，恶性胆固醇增加，从而令肝脏的解毒功能增加负担，会加重慢性肝病的病情进展，甚至促进肝癌的发生。
香烟中含有很多的致癌物质，如尼古丁、吡啶、氢握酸、氨、烟焦油、一氧化碳、芳香类化合物等，长期吸烟就容易得癌，常见的有唇癌、舌癌、口腔癌、食道癌、胃癌、结肠癌、胰腺癌、肾癌和子宫颈癌。还有研究表明，烟雾中的致癌物质还能通过胎盘影响胎儿，致使其子代的癌症发病率显著增高。
吸烟会影响男子的生育功能。因为精子可以识别香烟中的尼古丁，并对它产生反应，长期吸烟就会使精子中尼古丁受体超载，从而使得受精的能力下降，对生育造成了影响。且有研究调查表明，长期吸烟者的精子受精能力较不吸烟者下降了75%。
孕妇吸烟不仅危害自己的健康，同时还可能对肚子里胎儿造成伤害。这是因为香烟中所含的烟碱和尼古丁会造成全身血管病变，子宫血管因此受累，使得孕妇在孕早期容易发生流产，孕中期易发生妊娠高血压，是怀孕期间最危险的并发症之一。
吸烟不仅危害个人身体健康，周围的人吸食二手烟危害更大。抽烟时喷出的烟雾可散发超过四千种气体和粒子物质，这些都是很强烈的刺激物，被周围的人吸入，会刺激眼、鼻和咽喉，甚至还可能会患上肺癌和心脏疾病。儿童吸收二手烟，还会出现咳嗽、气喘、痰多、损坏肺部功能和减缓肺部发育等影响。
