目前大多数的速溶咖啡中都含有植脂末，它的主要组成物质是氢化植物油、葡萄糖浆、酷朊酸钠、乳化剂等。氢化植物油中含有较多的反式脂肪酸物质，因此长期喝速溶咖啡可能会增加患高血脂等心脑血管疾病的患病概率。
很多的速溶咖啡为了口感更好会添加大量的糖，18g的咖啡里有10.4g是糖。喝两杯下去就吃掉了20多克的糖，占了一天推荐糖摄取量的23%以上，所以说长期喝下去并且不控制其它添加糖的摄取的话，会增加龋齿、肥胖、糖尿病、痛风等疾病的患病概率。
速溶咖啡的可致癌物质“丙烯酰胺 ”含量是现煮咖啡的百倍以上，丙烯酰胺属于2A类致癌物，而且速溶咖啡的咖啡豆大多数以中度烘焙为主，在加工的过程中，有可能丙烯酰胺还没有散尽，就磨粉包装了，所以丙烯酰胺的含量可能更高。
