对于大多数人来说，卵磷脂一般没有太明显的副作用，但曾被报导的可能副作用包括：腹泻、出汗过多、呕吐、恶心、腹痛或饱胀感等。
1、诱发过敏
卵磷脂通常从大豆、蛋黄、葵花籽或油菜籽中提取，因此可能含有原提取物残留的蛋白质。这意味着对黄豆、油菜籽、鸡蛋或向日葵种子过敏人群也可能会对卵磷脂起过敏反应，症状包括：皮疹、唿吸困难、面部、嘴唇、舌头或喉咙肿胀。
2、增加心血管疾病风险
卵磷脂的代谢物：胆硷(choline)在肠道中会转化为氧化叁甲胺(trimethylamine oxide (TMAO))，而较高的TMAO水平与发生重大心血管不良事件的风险增加有关
3、导致肥胖
卵磷脂参与脂肪生成和肝脏脂质累积，若过量可能与肥胖和肝脏脂肪变性有关。
1、由于卵磷脂不耐高温，一般在50℃以上的温度下活性会逐渐破坏而消失，所以，服用卵磷脂要注意用温水冲服。
2、服用之前打开包装后，如果发现胶囊颗粒粘连在一起，不能完整的分开或者出现有拉丝的现象，那么一定不能够服用。另外，如果药物内有液体渗出，也应禁止服用。
3、人体每天摄取卵磷脂通常没有特殊的限制，每天1～2粒，分两次服即可。
1、 美国食品药品监督管理局(FDA)规定：在婴幼儿奶粉里，必须添加磷脂。
2、 学生、知识分子及中老年人：卵磷脂能增强大脑活力，消除大脑疲劳，增强记忆力，提高学习工作效率。而且能修复受损伤的脑细胞，预防老年性痴呆症的发生。
3、长期饮酒、营养过剩及脂肪肝患者：每日服用10-15克卵磷脂，3-5个月后，血脂指标可恢复到正常水平。
4、糖尿病患者：每天食用20克以上的大豆卵磷脂，糖尿病人的恢复速度是相当明显的，很多病人可不必再注射胰岛素。对糖尿坏疽及动脉硬化等并发症患者，更为有效。
5、胆结石患者：每天坚持服用大豆卵磷脂，不仅能防止胆结石形成，而且还可以不同程度地分解、消除已形成的胆结石。
6、爱美的女士：百爱卵磷脂是一种天然解毒剂，能分解体内的毒素。通过增加血红素，为皮肤提供充分的水和氧气等营养，使皮肤变得光滑柔润
7、便秘人群：卵磷脂可以促进肠胃血液循环及肠胃蠕动，有助于预防及改善便秘。
